در دنیای امروز زیستشناسی، داشتن یک لیست بلند از ژنهای متفاوت بیان شده، فقط شروع کاره. هنر اصلی اینه که بتونی از دل این دادههای خام، نقشههای ارتباطی معنادار دربیاری و مکانیسمهای سلولی رو کشف کنی. این دوره دقیقاً همینه: یه راهنمای عملی برای کس...
تحلیل شبکههای زیستی با Cytoscape: از داده تا کشف
در دنیای امروز زیستشناسی، داشتن یک لیست بلند از ژنهای متفاوت بیان شده، فقط شروع کاره. هنر اصلی اینه که بتونی از دل این دادههای خام، نقشههای ارتباطی معنادار دربیاری و مکانیسمهای سلولی رو کشف کنی. این دوره دقیقاً همینه: یه راهنمای عملی برای کسایی که میخوان تحلیل شبکههای پروتئینی و میکروآرنا رو برای پایاننامه یا مقالهشون انجام بدن.
چرا یادگیری تحلیل شبکه اینقدر مهمه؟
شبکههای برهمکنش پروتئین-پروتئین (PPI) و تنظیمگرهای میکروآرنا (miRNA)، مثل نقشه گنج بیماریهای پیچیدهای مثل سرطان عمل میکنن. بدون تسلط بر ابزارهای تحلیل این شبکهها، خیلی از ارتباطات پنهان مولکولی ناشناخته میمونن.
مثال ساده: فکر کن تو یه پروژه تحقیقاتی، با استفاده از تکنیکهایی مثل RNA-seq به ۲۰۰ ژن با بیان متفاوت رسیدی. حالا سوال اصلی اینجاست: کدوم یکی از این ژنها واقعاً کلیدی و هاب (Hub) محسوب میشن؟ مسیرهای سیگنالینگ مشترکشون چیه؟ و آیا میکروآرناهای تنظیمکنندهشون رو میشنیاس؟ این دوره جواب همین سوالات رو بهت یاد میده.
در این دوره دقیقاً چه مهارتهایی کسب میکنی؟
این آموزش بر اساس یه رویکرد کاملاً عملی و پروژه-محور طراحی شده. قرار نیست فقط تئوری بخونی؛ بلکه گام به گام با داده واقعی کار میکنی تا به خروجی قابل انتشار برسی.
مهارتهای محوری فصل اول (تحلیل شبکه PPI):
* ساخت شبکه برهمکنش پروتئین-پروتئین از پایگاه داده معتبر STRING.
* وارد کردن و مدیریت داده در نرم افزار استاندارد Cytoscape.
* شناسایی ماژولها یا زیرشبکههای عملکردی با پلاگین MCODE.
* پیدا کردن ژن های مرکزی و کلیدی (Hub Genes) با استفاده از پلاگین CytoHubba.
* آنالیز غنی سازی مسیر (Pathway Enrichment) برای تفسیر بیولوژیکی نتایج.
* یادگیری اصول مصورسازی حرفه ای (Publication-Quality Visualization) برای مقالات.
مهارت های تکمیلی فصل دوم (تحلیل شبکه miRNA-mRNA):
* پیش بینی و استخراج برهمکنش های میکروآرنا با ژن های هدف از منابعی مثل miRWalk.
* ساخت شبکه های تنظیمی یکپارچه.
* تلفیق لایه اطلاعاتی میکروآرنا با شبکه های PPI برای درک عمیق تر مکانیسم ها.
مشخصات کلی دوره
عنوان
توضیح
عنوان دوره
آموزش جامع بیوانفورماتیک سیستم ها: تحلیل شبکه های PPI و miRNA با Cytoscape
سطح دوره
تخصصی (مناسب برای دانشجویان کارشناسی ارشد، دکتری و پژوهشگران)
رویکرد آموزشی
عملی (Hands-on) و پروژه محور
پیش نیاز خاص
آشنایی مقدماتی با مفاهیم بیوانفورماتیک
زمان تقریبی محتوا
حدود ۳ ساعت آموزش کاربردی
چرا این دوره رو انتخاب کنم؟
خیلی از آموزش ها درگیر مباحث مقدماتی می شن یا فقط به معرفی ابزارها بسنده می کنن. نقطه قوت این دوره اینه که مستقیماً سراغ مهارت هایی می ره که برای تعریف پروژه، انجام آنالیز و نوشتن بخش نتایج مقاله به اونها نیاز داری. بعد از گذروندن این آموزش، تو قادر خواهی بود:
یک پروژه کامل تحلیل شبکه را از صفر تا صد انجام بدی.
خروجی های استاندارد و قابل قبول برای ژورنال های معتبر تولید کنی.
داده های خام خودت را به داستان زیستی معنادار تبدیل کنی.
با توجه به تخفیف ویژه فعلی، فرصت مناسبی هست تا این مهارت کاربردی رو با هزینه مقرون به صرفه ای به مجموعه توانایی هات اضافه کنی. یادت باشه تسلط بر ابزاری مثل Cytoscape امروزه تبدیل به یک امتیاز مهم در رزومه پژوهشگران علوم زیستی شده.
📜 شرکت کنندگان در پایان دوره گواهینامه دریافت خواهند کرد.
نکته پایانی: هدف ما این نیست که فقط چند نرم افزار رو بهت معرفی کنیم. هدف اینه که بتونی مانند یک متخصص بیوانفورماتیک سیستم ها فکر کنی و مسائل پیچیده زیست شناسی را با رویکرد شبکه ای تحلیل کنی.
تحلیل شبکههای پروتئینی و میکروآرنا با Cytoscape را بیاموزید.
ثبت
